مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراج‌شده توس‌کیت برای ردیابی ژن‌هایOPrL ،ExoA ، algDدر ایزوله‌های بالینی سودوموناس آئروژینوزا

Authors

  • ادبی, جواد گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران
  • زینی, بهروز دانشگاه علوم پزشکی زاهدان
  • شهرکی زاهدانی, شهرام دانشگاه علوم پزشکی زاهدان
Abstract:

زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا، یکی از رایج‌ترین عوامل عفونت‌های بیمارستانی محسوب می‌شود. بیشتر آزمایشگاه‌ها به‌طور معمول برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا، از روش کشت و تست‌های بیوشیمیایی مختلف استفاده می‌کنند که روشی وقت‌گیر بوده و در برخی موارد دارای نتایج مثبت و منفی کاذب می‌باشد. هدف از انجام این پژوهش مقایسه دو روش مولکولی PCR با استفاده از DNA استخراج‌شده با کیت و PCR با استفاده از کلنی مستقیم در تشخیص ایزوله‌های سودوموناس آئروژینوزا بود. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی – تحلیلی، از 395 ایزوله بالینی مختلف، 85 ایزوله با تست‌های بیوشیمیایی اولیه و کشت بر روی محیط‌های اختصاصی سودوموناس آئروژینوزا تشخیص داده شدند. سپس با استفاده از ژن‌های OPrL،ExoA ، algD با دو روش مولکولی PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراج‌شده با کیت، مورد ارزیابی قرار گرفتند. یافته‌ها: از مجموع 85 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا که به روش فنوتیپی، غربالگری‌ شده بودند، 81 ایزوله به روش PCR با استفاده از DNA استخراج‌شده با کیت، حاوی ژن‌های OPrL، ExoA، algD (با طول نوکلئوتیدهای 504، 396 و 526 جفت باز) و80 ایزوله نیز به روش PCR مستقیم، دارای ژن‌های مذکور بودند. نتیجه‌گیری: نتایج این تحقیق نشان داد بدون استفاده از کیت‌های استخراج می‌توان به نتایج تشخیصی قابل‌قبول در شناسایی سودوموناس آئروزینوزا دست یافت. از طرفی، در نتایج به‌دست‌آمده می‌توان خطای روش‌های تشخیصی فنوتیپی سودوموناس آئروژینوزا را مشاهده کرد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استفاده از روش استخراج DNA در تعیین تیپ‌های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس

     واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماری‌زا محسوب می‌شود و جداسازی DNA اولین گام در این مسیر است.  استخراج DNA یک مرحله وقت‌گیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار می‌آید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام PCR طولانی‌تر است.  هدف از انجام این تحقیق، استفاده از PCR مستقیم (بدون استخراج DNA) جهت تعیین تیپ‌های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس می‌باشد.  در ای...

full text

مقایسه دو روش pcr مستقیم و pcr با استفاده از روش استخراج dna در تعیین تیپ های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس

واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماری زا محسوب می شود و جداسازی dna اولین گام در این مسیر است.  استخراج dna یک مرحله وقت گیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار می آید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام pcr طولانی تر است.  هدف از انجام این تحقیق، استفاده از pcr مستقیم (بدون استخراج dna) جهت تعیین تیپ های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس می باشد.  در این تحقیق pcr مس...

full text

تعیین الگوی فلاژلین (flic) سودوموناس آئروژینوزا در سویه های بالینی به روش pcr

مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا اغلب پاتوژن شایع جدا شده از عفونت های سوختگی است که به دلیل پایداری بالا در محیط و مقاومت بالای آنتی بیوتیکی به صورت ذاتی و اکتسابی می باشد. با توجه به اهمیت فلاژل در پاتوژنز عفونت های سودوموناس آئروژینوزا امروزه استفاده از پلی کلونال آنتی بادی ضد فلاژلین برای درمان چنین عفونت هایی مورد توجه قرار گرفته است. شناسایی و تعیین تیپ فلاژلین ((flic و همچنین تعیین فراوانی تی...

15 صفحه اول

بررسی فراوانی موتاسیون ژن PA3721 در سویه های سودوموناس آئروژینوزا تولیدکنندهESBL و فاقدESBL با روش PCR

مقدمه: بعضی از سویه های سودوموناس آئروژینوزا، بتالاکتامازهای طیف وسیع را تولید می کنند که باعث مقاومت به سفالوسپورین های طیف وسیع مانند سفو تاکسیم، سفتریاکسیون، سفتازیدیم و هم چنین مونوباکتام هایی از قبیل آزترونام می شوند. یکی از عوامل ایجادکننده مقاومت در برابر آنتی بیوتیک ها در سویه های سودوموناس آئروژینوزا افزایش بیان پمپ های تراوشی است، که از مهم ترین این پمپ ها می توان پمپ MexAB-OprM را نا...

full text

شناسایی ژن پیووردین Pyoverdine در جدایه های دامی و انسانی سودوموناس آئروژینوزا با روش Multiplex-PCR

Background and Aim: Pseudomonas aeruginosa is one of the most important factors in hospital infections, especially in patients with immune deficiency and Childhood diseases. The Virulence of bacteria are due to the presence of the Pyoverdine gene, which has many effects on the wild type of bacteria during the pathogenic pathway. Identification of different classes of PVD gene is necessary for t...

full text

طراحی پرایمرهای اختصاصی برای نشان دادن ژن‌های exoA، oprL و algD برای تشخیص سریع سویه‌های سودوموناس آئروژینوزا در نمونه‌های بالینی

Background: The aim of this study was compared the efficacy of  the designed primers and already published primers for detection of the exoA, oprL and algD genes by PCR assay  for finding a rapid, accurate and highly sensitive and specific procedure to detect the Pseudomonas aeruginosa in the serious and fatal infections such as cystic fibrosis disease, burned individual.Methods: A total of 150...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 11  issue 3

pages  11- 21

publication date 2017-05

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023